2015-2016赛季，巴萨的王牌三叉戟组合已臻完美。联赛国家德比首轮，巴萨4-0横扫皇马。梅西在2015年世俱杯决赛中率队3-0战胜河床，获得第五个金球奖。同年12月30日，梅西在对阵贝蒂斯的比赛中，为巴萨出战500次。
不过齐达内上任后，逐渐缩小了皇马和巴萨之间的差距，红蓝军团苦战至最后一轮，成功卫冕联赛冠军。但在欧冠赛场上，巴萨在四分之一决赛中不敌马竞，梅西率领巴萨在国王杯决赛中加时战胜塞维利亚，才夺得冠军。梅西率领“MSN”组合单赛季进球数达到131个，超越自己保持的纪录。
2016-2017赛季是巴萨“MSN”组合的最后一个赛季，在伊涅斯塔受伤的情况下，梅西以队长身份捧起了西班牙超级杯。然而巴萨在赛季后半段开始逐渐崩盘，在欧冠1/4决赛首回合0-4惨败后，他们在第二回合主场6-1逆转淘汰对手，然而在随后的1/4决赛中巴萨西甲冠军年份巴萨西甲冠军年份，巴萨却被尤文图斯直接0-3横扫出局。
巴萨虽然在国王杯决赛中3-1战胜阿拉维斯夺得冠军，但西甲冠军却败给了皇马，而对巴萨最致命的打击莫过于内马尔在赛季结束后被巴黎圣日耳曼买断合同，巴萨“MSN”组合也成为历史。
在职业足球越来越商业化的今天，球员从顶级俱乐部开始职业生涯，并在该俱乐部度过职业生涯最后几年的情况已经很少见。出乎意料的是，今天对梅西巴萨生涯的回顾，并不是他足球生涯的终结篇，而是对红蓝军团过往的追忆，并将成为他下一站的序幕。
在小罗离队之后，梅西接过了巴萨王者的权杖，2008-2009赛季初，梅西开启了自己的巅峰模式，帮助巴萨开启了“梦三”王朝和“MSN”执政时代。
“梦二队”彻底解体后，瓜迪奥拉上任，开启了重建工作。小罗离队后，梅西得到了巴萨的10号球衣。此前，梅西因肌肉伤病在2006年至2008年总共缺席了8个月。为了保证梅西的出勤率，红蓝军的技术团队为他量身定制了新的训练和营养计划。
没想到，完成大变革的巴萨在瓜迪奥拉的执教下踢出了统治力十足、传控漂亮的足球。梅西、亨利、埃托奥组成的三叉戟在进攻上非常犀利，2008-2009赛季，三人共进了100球。瓜迪奥拉安排梅西自由地从右路内切到中路，大大释放了梅西的进攻天赋。阿根廷前锋51场打进38球，个人进球数据有了质的飞跃。
此外巴萨西甲冠军年份，在国家德比第二轮比赛中，瓜迪奥拉创造性地安排梅西打假中锋，梅西深入中场，与哈维、伊涅斯塔一起打出统治级表现。最终，梅西单场打入2球，率队6-2横扫皇马，在伯纳乌完成“马德里屠杀”。随后，梅西率队在国王杯中4-1战胜毕尔巴鄂，力压皇马夺得联赛冠军。梅西在当赛季的欧冠赛场上打入9球，不仅首次成为欧冠最佳射手，还率领巴萨在决赛中2-0战胜曼联夺得冠军。梅西率领巴萨单赛季夺得三冠王。
巴萨迅速与梅西签订了新合同，截止时间为2016年夏天，违约金升至2.5亿欧元，薪水达到1200万欧元。梅西率领红蓝军团连续夺得西班牙超级杯、欧洲超级杯和世俱杯冠军，使巴萨成为第一支一年内夺得六冠王的足球队！梅西还获得了金球奖。
2009-2010赛季，虽然梅西打出更加恐怖的数据，53场打进47球，但却被穆里尼奥功利主义的球风所困，巴萨在欧冠半决赛被国米淘汰，梅西共打进8球，第二次荣膺欧冠最佳射手。在国内赛场，巴萨虽然输掉了国王杯，但共打进34粒西甲进球，夺得欧洲金靴奖。
2010-2011赛季，梅西55场打进53球，单场进球接近1球。赛季初，梅西用个人神级表现帮助巴萨夺得杯赛冠军。在西班牙超级杯首轮不敌塞维利亚后，梅西在第二轮上演帽子戏法，率队4-0逆转，最终夺得冠军。随后在联赛国家德比首轮，梅西率领巴萨5-0大胜。
可以说，穆里尼奥当时执教皇马，开辟了近10年来国家德比的巅峰。在赛季后半段，巴萨和皇马在18天内共打出了4场国家德比。虽然巴萨在国王杯决赛中加时不敌皇马，但在最重要的欧冠半决赛中，梅西在伯纳乌首回合梅开二度，帮助红蓝军团2-0取胜，直接奠定了晋级基础。
在联赛卫冕成功后，梅西带领“MVP”组合闯入欧冠决赛。在温布利大球场面对曼联，巴萨的传控球让红魔无计可施。最终，巴萨3-1战胜曼联。看弗格森当时颤抖的手，就能看出巴萨的发挥有多么糟糕，曼联有多么无力。赛季结束时，梅西已经打进53球，助攻24次，成为巴萨和西班牙足球史上第一位单赛季进球突破50球大关的球员。
2011-2012赛季是梅西连续打破纪录的一个赛季。那时的梅西已经是集8号创造者、9号终结者和10号助攻者三大角色于一身的超级球员。梅西在那个赛季史无前例地打入73球，超越了盖德·穆勒在1972-1973赛季创下的欧洲单赛季个人进球纪录。此外，梅西还助攻29次，完成10次帽子戏法。
西班牙超级杯，梅西打入3球，帮助巴萨5-4战胜皇马夺冠，并总共打入8球成为西班牙超级杯历史最佳射手。2011年世俱杯决赛4-0战胜桑托斯后，梅西率领巴萨完成年度五冠王！他还第三次获得金球奖。
赛季后半段，梅西继续着惊人的爆发，欧冠1/4决赛对阵勒沃库森的比赛中，梅西单场轰入5球，单赛季欧冠进球总数达到14粒，追平了阿尔塔菲尼在1962-1963赛季保持的纪录。
但当时瓜迪奥拉执教的巴萨已是强弩之末，尽管该赛季巴萨在国王杯中击败毕尔巴鄂竞技夺冠，但在联赛中却不敌皇马，未能实现三连冠，此外在欧冠半决赛中更是不敌切尔西，而梅西最大的遗憾便是在第二回合比赛中罚失点球。
瓜迪奥拉离队后，巴萨再次进入混乱期。虽然梅西率领巴萨在2012-2013赛季追平了皇马保持的100分西甲冠军纪录，并单赛季攻入46球，但在国王杯赛场上被皇马淘汰，欧冠半决赛两回合被拜仁慕尼黑7-0横扫。但凭借出色的个人表现，梅西在2012年创造了单年91球的世界纪录，第四次荣膺金球奖。
2013-2014赛季，内马尔加盟巴萨，梅西有了得力助手。但马蒂诺执教相当糟糕，巴萨当赛季三线全败。即便内马尔被认为是巴萨未来的领袖，但梅西的王者地位却不可动摇。巴萨高层与梅西在2014年5月签订了新合同，将梅西的薪水提高到2000万欧元，成为足坛最高年薪。
梅西在巴西世界杯决赛中不敌德国，但回到巴萨后却得到了苏亚雷斯加盟的消息。在路易斯·恩里克的调教下，巴萨凭借“MSN”组合的出色发挥，在赛季后半段开始爆发，开启了球队历史的新纪元。
梅西成为西甲历史最佳射手，也是当赛季加泰罗尼亚德比的最佳射手。2015年1月11日对阵马竞的比赛中，梅西、内马尔和苏亚雷斯首次联手大爆发。为了助攻苏亚雷斯，梅西重回右边锋位置。当赛季，他们三人一共打进122球，创造了西班牙足球史上新纪录。